In "Kill me Baby!" geht es im Groben um das nicht ganz normale tägliche Schulleben von Yasuna, einem hyperaktiven, verrückten braunhaarigen Mädchen und der blonden Attentäterin Sonya. Während Yasuna immer wieder versucht, mit Sonya Freundschaft zu schließen, hat diese jedoch ganz andere Absichten. Und dann gibt es noch die hübsche Ninja Agiri, die mit einer Reihe sehr fragwürdiger Fähigkeiten für viel Unterhaltung sorgt.