Okajima Rokuro, von heute eigentlich nur noch Rock, war seine längste Zeit ein japanischer Geschäftsmann gewesen. Als festes Crewmitglied der Black Lagoon mischt er mit Revy und Co. die Unterwelt ordentlich auf. Black Lagoon 2 ist die direkte Fortsetzung des genialen Action Anime Krachers. Und wieder dreht sich alles um die Aufträge der Black Lagoon Company und die Machtspiele der Unterwelt.
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Ein geheimnisvoller Auftragskiller taucht in der Stadt auf und versucht das Mächtegleichgewicht aus der Bahn zuwerfen, aber dies lässt sich Miss Balalaika nicht gefallen. Es braucht nicht lange und Miss Balalaika erfährt wer hinter diesen Antentaten steckt und geht gemeinsam mit Chang auf die Jagd.